奧尻郡為日本北海道檜山振興局的郡，位於檜山振興局西部外海的奧尻島。
轄區包含1町：
奧尻町
1869年8月15日：
北海道設置11國86郡，后志國奧尻郡成立。
1897年11月：北海道實施支廳制，此時奧尻郡下轄鈴懸村、赤石村、青苗村、藥師村。（4村）
1906年4月1日：鈴懸村、赤石村、青苗村、藥師村合併為奧尻村，並成為北海道二級村。（1村）
1943年6月1日：北海道一級二級町村制廢止，奧尻村改為
內務省指定村。
1946年10月5日：指定町村制廢止。
1966年1月1日：奧尻村改製為奧尻町。（1町）