同尾酶

這一類的限制酶來源各異，識別的靶序列也不相同，但產生相同的粘性末端。由 同尾酶（isocaudamer)產生的DNA片段，是能夠通過其粘性末端之間的互補作用彼此連接起來的。當把同尾酶切割的DNA片段與原來的限制性內切酶切割的DNA片段連接后，原來的酶切位點將不存在，不能被原來的限制性內切酶所識別。

例如：BamHI和Bgl II，Sal I和Xho I 就是我們常見的同尾酶。

BamH I的切割位點如下：

5'-G^GATCC-3'

3'-CCTAG^G-5'

Bgl II的切割位點如下：

5'-A^GATCT-3'

3'-TCTAG^A-5'

Sal I的切割位點如下：

5'-G^TCGAC-3'

3'-CAGCT^G-5'

Xho I的切割位點如下：

5'-C^TCGAG-3'

3'-GAGCT^C-5'

是基因工程重要的工具酶。