DNA雜交
DNA分子形成穩定的雙鏈區
DNA雜交是指具有互補鹼基序列的DNA分子，可以通過鹼基對之間形成氫鍵等，形成穩定的雙鏈區。在進行DNA分子雜交前，先要將兩種生物的DNA分子從細胞中提取出來，通過超聲或者其他物理方法，將DNA剪切成片段，再通過加熱或提高pH的方法，將雙鏈DNA分子分離成為單鏈，這個過程稱為變性。
然後，將兩種生物的DNA單鏈放在一起雜交，其中一種生物的DNA單鏈事先用同位素進行標記。如果兩種生物DNA分子之間存在互補的部分，就能形成雙鏈區。由於同位素被檢出的靈敏度高，即使兩種生物DNA分子之間形成百萬分之一的雙鏈區，也能夠被檢出。
分類學上不同物種的DNA分子之間可以進行分子雜交，但是，遠緣物種的DNA分子之間進行雜交分子的可能性遠比近緣物種的要小得多。例如，細菌與真核細胞DNA分子之間形成雜交分子的可能性很小；不同細菌的 DNA分子之間雜交時，能形成某些互補片段；人的DNA分子與小鼠的 DNA分子之間雜交時，只有少量的人DNA單鏈和小鼠DNA單鏈能形成雜交分子，而且只是部分鹼基配對。但是，人與鼠之間的DNA 雜交分子的形成，比人與酵母之間DNA雜交分子的形成要容易。在生物進化過程中，DNA中的鹼基序列也發生了變化。兩種生物的DNA單鏈之間互補程度越高，通過分子雜交形成雙螺旋片段的程度也就越高，二者的親緣關係就越近；反之，親緣關係就越遠。所以，可以通過DNA分子雜交技術來鑒定物種之間親緣關係的遠近。