持家基因
持家基因
持家基因(house-keeping genes),又稱管家基因,是指所有細胞中均要穩定表達的一類基因,其產物是對維持細胞基本生命活動所必需的。如微管蛋白基因、糖酵解酶系基因與核糖體蛋白基因等。管家基因是一類始終保持著低水平的甲基化並且一直處於活性轉錄狀態的基因。
管家基因表達水平受環境因素影響較小,而且是在個體各個生長階段的大多數,或幾乎全部組織中持續表達,或變化很小,因此常存在於生物細胞核的常染色質中。它的表達只受啟動序列或啟動子與RNA聚合酶相互作用的影響,而不受其他機制調節。
管家基因高度保守並且在大多數情況下持續表達,因此管家基因常被用於分子技術--多位點基因分析。一般來說多位點基因分析通常需7個管家基因位點(金黃色葡萄球菌),某些時候可能到10個基因位點(致傷弧菌)。
人類看家基因列表如下(部分基因,最常用的是ACTB和GAPDH),這是Trends in Gentics文獻(Human housekeeping genes are compact)上分析得來的。
*NM_001101 Homo sapiens actin, beta (ACTB), mRNA6988
*NM_000034 Homo sapiens aldolase A,fructose-bisphosphate (ALDOA), mRNA3425
*NM_002046 Homo sapiens glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPD), mRNA828
*NM_000291 Homo sapiens phosphoglycerate kinase 1 (PGK1), mRNA2727
*NM_005566 Homo sapiens lactate dehydrogenase A (LDHA), mRNA2105
*NM_002954 Homo sapiens ribosomal protein S27a (RPS27A), mRNA4156
*NM_000981 Homo sapiens ribosomal protein L19 (RPL19), mRNA6997
*NM_000975 Homo sapiens ribosomal protein L11 (RPL11), mRNA6060
*NM_007363 Homo sapiens non-POU domain containing, octamer-binding (NONO), mRNA1708
*NM_004309 Homo sapiens Rho GDP dissociation inhibitor (GDI) alpha (ARHGDIA), mRNA1358
*NM_000994 Homo sapiens ribosomal protein L32 (RPL32), mRNA9523
*NM_022551 Homo sapiens ribosomal protein S18 (RPS18), mRNA11261
*NM_007355 Homo sapiens heat shock 90kDa protein 1, beta (HSPCB), mRNA4119