B型DNA
B型DNA
1953年徠Watson和Crick在nature上發表了DNA雙螺旋模型首次簡要闡明了複雜DNA分子的二級結構,明確提出特異鹼基配對可能是遺傳物質的複製機制。
要點如下:
1徠.兩條反向平行的互補雙螺旋鏈,一條方向為5‘→3’,另一條方向為3‘→5’,圍繞同一中心縱軸,從右向上盤旋。
2.雙螺旋磷酸-脫氧核糖主鏈在外,位於內的鹼基平面與中心軸垂直。
3.每個鹼基相聚0.34nm,同條鏈相鄰鹼基夾角36度,每10個鹼基形成螺旋1周,螺距3.4nm。
4.露於螺旋外的磷原子離中心軸1.0nm,易與陽離子接近。
6.兩條單鏈之間由小溝,兩個雙鏈之間有大溝,他們在DNA雙螺旋外交替出現。
在Watson和Crick發現DNA B型雙螺旋的同一時期,麻省理工學院的A.Rich等科學家提出了一種被稱之為Z-DNA左手螺旋,糖磷酸骨架呈鋸齒狀排列,外面只有一條溝。每個Z-DNA螺旋含有12個鹼基對,螺距為4.5nm。在高離子強度環境下,一條長的DNA片段中如有嘌呤嘧啶交替排列,即可呈Z構象。將Z-DNA雙鏈中鹼基C甲基化,有助於左手螺旋的穩定。某些證據表明Z-DNA可能影響基因的表達。
多年來,B型DNA和Z型DNA究竟如何結合在一起,對科學家來說一直是謎。韓國成均館大學及中央大學科學家組成的課題組,採用X射線晶體結構分析法,首次獲得了這兩種DNA結合處的三維結構,並由此闡明了兩種不同結構DNA如何能夠結合的機理。
幾種主要的DNA二級結構對照表
DNA模型 | 螺旋方向 | 直徑(nm) | 鹼基數/螺旋 | 螺距(nm) | 旋轉角度/鹼基 | 其它結構特徵 | 存在情況 |
B-DNA | 右手 | 2 | 10 | 3.54 | 36º | 平滑旋轉梯形螺旋結構 | 92%RH,鈉鹽,溶液和細胞中天然狀態中的DNA多以此狀態存在 |
A-DNA | 右手 | 11 | 2.53 | 32.7º | 鹼基不與中心軸垂直,呈20º傾角 | 75%RH,鈉鹽 | |
C-DNA | 9.3 | 3.1 | 38º | 66%RH,鋰鹽,可能存在於某些病毒DNA中 | |||
Z-DNA | 左手 | 1.8 | 12 | 4.56 | -60º | 主鏈中P原子連接線呈鋸齒形,似“Z”字,分子細長伸展,鹼基對偏離中心軸而靠近外側,螺旋表面只有小溝,無大溝 | 在一定條件下右旋DNA可轉變為左旋,DNA左旋化可能與致癌、突變及基因表達調控有關 |
另外還有D型和E型等,研究少一些。DNA二級結構也還存在三股螺旋DNA,三股螺旋DNA存在於基因調控區和其他重要區域,因此具有重要生理意義。