在每種蛋白質中，多肽鏈中氨基酸的排列順序，包括二硫鍵的位置，我們稱為蛋白質的一級結構，也叫初級結構或基本結構。蛋白質一級結構是理解蛋白質結構、作用機制以及與其同源蛋白質生理功能的必要基礎。
蛋白質一級結構
蛋白質一級結構(primary structure)
指蛋白質中共價連接的氨基酸殘基的排列順序，包括二硫鍵的位置。
蛋白質的一級結構包括：
（1）組成蛋白質的多肽鏈的數目；
（2）多肽鏈的氨基酸順序；
保守天冬氨酸和谷氨酸殘基
（3）多肽鏈內或鏈間二硫鍵的數目和位置。
1.測定多肽鏈的數目
2.拆分多肽鏈
3.斷開多肽鏈內的二硫鍵
4.測定每一肽鏈的氨基酸組成
5.鑒定多肽鏈的N-末端和C-末端
6.裂解多肽鏈為較小的肽段
7.測定各肽段的氨基酸序列
8.利用重疊肽重建完整多肽鏈的一級結構
9.確定二硫鍵的位置
