bwa

BWA-Broadband Wireless Access　寬頻無線接入，面向的主要應用是IP數據接入和話音接入。

BWA-Burrows-Wheeler Alignment tool 基於BWT的生物序列比對工具

bwa是為二代測序的短序列比對參考序列（reference，fasta格式）而開發的比對軟體。需要先對參考序列建庫。根據測序方法的不同，有單末端序列（single-end，SE）比對和雙末端序列（pair-end，PE）比對。