PubMed
生物醫學方面的論文搜尋引擎
PubMed是一個免費的搜尋引擎,提供生物醫學方面的論文搜尋以及摘要的資料庫。它同時也提供對於相關生物醫學資訊上相當全面的資源,像是生化學與細胞生物學。該搜尋引擎是由美國國立醫學圖書館提供,作為Entrez資訊檢索系統的一部分。PubMed的資訊並不包括期刊論文的全文,但可能提供指向全文提供者(付費或免費)的鏈接。
PubMed是網際網路上使用最廣泛的免費MEDLINE,是美國國家醫學圖書館(NLM)所屬的國家生物技術信息中心(NCBI)於2000年4月開發的,基於WEB的生物醫學信息檢索系統,它是NCBIEntrez整個資料庫查詢系統中的一個。PubMed界面提供與綜合分子生物學資料庫的鏈接,其內容包括:DNA與蛋白質序列,基因圖數據,3D蛋白構象,人類孟德爾遺傳在線,也包含著與提供期刊全文的出版商網址的鏈接等。
PubMed系統的特徵工具欄提供輔助檢索功能、側欄提供其它檢索如期刊資料庫檢索、主題詞資料庫檢索和特徵文獻檢索。提供原文獲取服務免費提供題錄和文摘,可與提供原文的網址鏈接,提供檢索詞自動轉換匹配,操作簡便、快捷。
辭彙自動轉換功能(automatictermmapping)PubMed主頁的檢索提問框中鍵入檢索詞,系統將按順序使用如下4種表達或索引,對檢索詞進行轉換后再檢索。
MeSH轉換表(MeSHTranslationTable)包括MeSH詞、參見詞、副主題詞等。如果系統在該表中發現了與檢索詞相匹配的詞,就會自動將其轉換為相應的MeSH詞和TextWord詞(題名詞和文摘詞)進行檢索。
刊名轉換表(JournalTanslationTable)包括刊名全稱、MEDLINE形式的縮寫和ISSN號。該轉換表能把鍵入的刊名全稱轉換為“MEDLINE縮寫[JournalNanme]”後進行檢索。如:在檢索提問框中鍵入:“newenglandjournalofmedicine”,PubMed將其轉換為“NEng1JMed[JournalName]”後進行檢索。
短語表(Phraselist)該表中的短語來自MeSH、含有同義詞或不同英文辭彙書寫形式的統一醫學語言系統(UMLS:UnifiedMedicalLanguageSystem)和補充概念(物質)名稱表[SupplementaryConcept(Substance)Namd]。如果PubMed系統在MeSH和刊名轉換表中未發現與檢索詞相匹配的詞,就會查找短詞表。
PubMed醫學文獻檢索服務系統,其數據主要來源有:MEDLINE、OLDMEDLINE、Recordinprocess、Recordsuppliedbypublisher等。數據類型:期刊論文、綜述、以及與其它資料庫鏈接。
PubMed
MEDLINE收錄1966年以來的包含醫學、護理、獸醫、健康保健系統及前臨床科學的文獻1600萬餘條書目數據(2005年數據),記錄的標記為[PubMed-indexedforMEDLINE]。這些數據來源於70多個國家和地區的4800多種生物醫學期刊,近年數據涉及30多個語種,回溯至1966年的數據涉及40多個語種,90%左右為英文文獻,70%~80%的文獻有著者撰寫的英文摘要。
InProcessCitations1996年8月開始,每天收錄由MEDLINE的期刊出版商提供的尚未經過規範化處理的數據,該庫中的記錄只具有簡單的書目信息和文摘、記錄標記為[PubMed-inprocess]。當該庫中數據被標引MeSH詞、文獻類型及其他數據時,每星期轉入MedLine一次,而被處理前的數據從該資料庫中刪除。
OLDMEDLINE:含1950年至1965年期間發表的200萬篇生物醫學文獻。OldMedline的記錄沒有MeSH欄位和摘要,記錄的標記為:[PubMed-OLDMEDLINEforPre1966]。
Publisher-SuppliedCitations(ArticlesNotinMEDLINEorINProcess)是由出版商提供的電子文獻,每條記錄標有[PubMed–assuppliedbypublisher]。這些文獻包括兩種來源:MEDLINE收錄範圍的文獻,每日被添加到InProcessCitation中去,換上[PubMed–inprocess]的標記,並賦予一個MEDLINE的數據識別號UI;不屬於MEDLINE收錄範圍的文獻則只有PubMed數據識別號PMID而沒有MEDLINEUI。
1.JournalDatabase:可透過輸入期刊刊名、ISSN或Medline刊名縮寫查詢期刊的出版資訊。
2.MeSHDatabase:點選此功能后,在檢索欄位中輸入欲查詢的辭彙,可瀏覽PubMed資料庫中所使用控制辭彙。
3.SingleCitationMatcher:使用欄位化的檢索方式,找尋特定刊名、卷期、作者、篇名的文獻資料。
4.BatchCitationMatcher:以指令式的方式批次檢索資料庫中相關的文獻,只要輸入刊名、年代、卷期、起始頁、作者名、關鍵詞其中部分欄位資料即可。
5.ClinicalQueries:臨床病理資料,該功能提供臨床病理資料之查詢,並依HaynesRB等專家所制訂的最佳化檢索策略之機制,使用者可先行選擇檢索方向,如:治療方式(Therapy)、診斷方式(Diagnosis)、病因(Etiology)、預后狀況(Prognosis)其中的一類,並可選擇預期之檢索結果是較具相關性(sensitivity)或精確率(specificity)較高的。
6.LinkOut:LinkOut為PubMed提供使用者連結外部網路資源之功能選項,連結內容包括國外圖書館館藏目錄、線上電子全文、書目資料庫清單、消費者健康資訊、研究參考資料等資訊。如有外部資源的連結,使用者可在PubMed摘要書目中看到LinkOut此一選項。
7.免費個人化檢索服務—MyNCBI:在MYNCBI服務頁建立個人檢索帳號/密碼后,即可使用個人化檢索服務,該服務提供儲存/刪除檢索結果、MyLinkOut設定及文獻傳遞等個人化服務
主題檢索:在PubMed主頁的檢索框中鍵入英文單詞或短語(大寫或小寫均可),PubMed即使用其辭彙自動轉換功能進行檢索,並把檢索結果直接顯示在主頁下方。例如:鍵入“vitaminccommoncold”后回車或點擊“Go”,PubMed開始檢索並把檢索結果顯示出來。
著者檢索:當所要查詢的是著作者時,在檢索框中鍵入著者姓氏全稱和名字的首字母縮寫,格式為“著者姓空格名字首字母縮寫”,例如smithja,系統會自動到著者欄位去檢索,並顯示檢索結果。
刊名檢索在檢索框中鍵入刊名全稱或MEDLINE形式的簡稱、ISSN號,例如:molecularbiologyofthecell,或molbiolcell,或1059-1524,系統把在刊名欄位檢索,並顯示檢索結果。
日期或日期範圍檢索可以在檢索框中鍵入日期或日期範圍,系統會按日期段檢索,並把符合條件的記錄予以顯示。日期的錄入格式為YYYY/MM/DD;如:1999/09/08。也可以不錄月份和日子,如:2000或1999/12。
檢索期刊子集(輯)檢索的格式為:檢索詞ANDjsubseta(或jsubsetd,或jsubsetn),如:neoplasmANDjsubseta。可供檢索的期刊子庫有3種:AbridgedIndexMedicus(有120種重要核心期刊)、Dental和Nursing。分別使用jsubseta,jsubsetd,jsubsetn進行限定。
檢索帶文摘的記錄檢索的格式為:檢索詞ANDhasabstract,如:livercancerANDhasabstract。要注意的是在1975年前出版的文章,其MEDLINE記錄中沒有文摘。
PubMed是NCBIEntrez數個資料庫查詢系統下中的一個。
PubMed是提供免費的MEDLINE、PREMEDLINE與其他相關資料庫接入服務,MEDLINE是一個擁有1億字條的巨大資料庫。
PubMed也包含著與提供期刊全文的出版商網址的鏈接,來自第三方的生物學數據,序列中心的數據等等。
PubMed提供與綜合分子生物學資料庫的鏈接與接入服務,這個資料庫歸NCBI所有,其內容包括:DNA與蛋白質序列,基因圖數據、3D蛋白構象,人類孟德爾遺傳在線。
漢化,讓中國的PubMed使用者盡量多的看到、使用自己更為熟悉的、美麗的中文
高級檢索頁面進行了漢化。
檢索關鍵詞進行了漢化提示。
網路詞典集成
檢索結果頁面集成了根據北京金葉天盛科技有限公司著名產品《新編全醫藥學大詞典》製作的網路詞典,對自己不熟悉的英語可以"雙擊"或"滑鼠選定"后查看網路詞典的翻譯結果。
GoPubMed是德國2006年創建2008年成熟推出對PubMed進行語義智能檢索、分類導航和深度開發的體現嶄新思維的網路檢索工具,也是一種對檢索結果進行多維統計分析的軟體。通過它用戶可以節省90%以上的網上搜索時間。檢索者可以很快了解檢索到文獻的概貌和該研究領域的研究態勢,如論文作者的研究軌跡、論文的年度分佈、全球核心作者及核心期刊、合著者可視化關係網路圖以及作者分佈世界地圖等等.
PubMed-cn
PubMed
為丁香園旗下網站,專業的醫學文獻資料庫,其數據每天與美國的NCBI數據中心同步一次。用戶在檢索文獻時,可以立即看到該文獻影響因子;用戶可以在期刊資料庫查詢影響因子變化趨勢、投稿指南、投稿經驗等相關的信息。並且PubMed-cn提供國家自然科學基金查詢,分析各個地區中標率,熱門學科,是申請NSFC的好幫手。