消息標識符是指用於標識OMCI消息的類型和實例號，它包含4位元組，前兩個最高有效位位元組用來指示消息類型中指定動作的目標受管實體，其中可能的受管實體的最大數自是65536；後面兩個最低有效位位元組用來識別受管實體實例。設備標識符該欄位用於對GPON設備的標識，並固定為0x0A。
OMCI 協議在OLT 控制器和ONT 控制器之間的
GEM 連接上運行，該連接在
ONT初始化時建立。OMCI 協議是非同步的:OLT 上的
控制器是"主"，ONT 上的控制器是"從"。一個OLT 控制器通過在不同的控制通道上使用多個協議實例來控制多個ONT。OMCI主要是主從式停等管理協議，其中
OLT是主設備，ONT是從設備，基本流程是OLT下發管理消息，等待ONT應答，得到應答后或超時后，繼續下發下一個消息。同時，ONT也會主動向OLT發起告警或者通知消息。