名偵探柯南：天空的遇難船

江戶川柯南

演員高山南

配音高山南

主人公。雖然外貌是小學生，但其真實身份是有名的高中生偵探工藤新一。被灌下黑衣組織開發的毒藥回到了小學生的模樣，但頭腦沒有改變，藉助阿笠博士開發的偵探工具，解決了一個又一個困難案件。喜歡吃檸檬派。生日是5月4日。運動神經超群尤其擅長足球，但是個音痴。一直守護著青梅竹馬的夥伴毛利蘭。

毛利蘭

演員山崎和佳奈

配音山崎和佳奈

工藤新一青梅竹馬的女同學。與父親小五郎和柯南3人生活在一起，不知道柯南的真實身份是新一。性格溫柔，開朗活潑。在高中里是空手道部的隊長，市裡空手道比賽的冠軍。一直惦記著以解決困難案件為理由而消失的新一，耐心的等著他回來。

毛利小五郎

演員小山力也

配音小山力也

在米花町開事務所的偵探。小蘭的父親，與妻子妃英理分居中。他雖然很清楚工藤新一是女兒小蘭的青梅竹馬，但是卻完全沒有察覺自己被柯南弄暈后解決了很多困難案件。拜其所賜，人稱“沉睡的小五郎”。是偶像沖野洋子的鐵桿粉絲。

怪盜基德

演員山口勝平

配音山口勝平

以裝腔作勢的口吻為特徵的聞名世界的神出鬼沒的大怪盜。他的能力超一流，是個連柯南都能騙過的變裝達人。犯罪前常大膽無畏地送上預告函，同時輕而易舉地盜走寶石與美術品。柯南最大的宿敵。

工藤新一

演員山口勝平

配音山口勝平

帝丹高中二年級的學生。擁有卓越推理能力的高中生偵探。人稱“平成的福爾摩斯”。足球水平是職業級的。雖與青梅竹馬的小蘭相互愛慕，但沒能表白就被變成了柯南。他決定如果能徹底變回新一，就對小蘭表白。

灰原哀

演員林原惠美

配音林原惠美

曾經是黑衣組織的一員名為宮野志保（組織代號為雪莉）。為了逃出組織，自己吃下了APTX4869而導致身體變小。父親是日本人，母親是英國人。現在與柯南同樣在帝丹小學上學。脫離組織之後，受到阿笠博士的幫助，現在寄宿在博士的家裡。

吉田步美

演員居由希子

配音居由希子

帝丹小學1年級的學生。是柯南的同學，也是少年偵探團成員。好奇心旺盛，很喜歡柯南。

小島元太

演員高木涉

配音高木涉

帝丹小學1年級的學生。是柯南的同學，也是少年偵探團團長。力氣很大，非常喜歡吃鰻魚飯。家裡是賣酒的。

圓谷光彥

演員大谷育江

配音大谷育江

帝丹小學1年級的學生。是柯南的同學，自稱是少年偵探團的智囊。對步美和灰原有好感，視柯南為情敵。父母都是教師。

阿笠博士

演員緒方賢一

配音緒方賢一

本名：阿笠博士（あがさひろし）。自稱天才發明家，並且是知道柯南真是身份的少數人之一。他是柯南的理解者，也是可靠的幫手。柯南的偵探道具都是阿笠博士發明的。雖然看起來是老爺爺的形象實際才52歲。會照顧人，與灰原哀生活在一起。愛車是甲殼蟲。