飲用水水源地保護，是中共中央、國務院明確的污染防治攻堅戰“七大標誌性戰役”之一。
水源保護區內存在的環境問題，主要包括：生活面源污染、工業企業排污、農業面源污染、旅遊餐飲污染、交通穿越等項目。
截止2018年8月，各地推進飲用水水源地環境問題清理整治工作，取得階段性成效。按照要求，各地排查縣級及以上飲用水水源地2466個，發現環境問題6426個。
2018年年底前，
長江經濟帶縣級、其他省份地級水源地要完成清理整治任務，共涉及1586個水源地的3991個環境問題；2019年年底前，所有縣級及以上城市水源地要完成清理整治任務。