Lod值

Lod值

LOD值 LOD score

定義:確定兩個基因座是否在染色體上距離很近,因此可能一起遺傳的統計學評估。三個或更多的LOD評價通常顯示了兩個基因座的位置很緊密。

理論介紹


詳解:遺傳學上通常用或然率的常用對數作為標準的衡量方法,該值的對數值稱為Lod值或對數優勢比:根據兩個非此即彼的假設,計算數據的整體或然性,以確定兩個基因座或是按一定的重組率而相互連鎖的可能性或是互不連鎖的可能性;這兩種可能性之比,是基因座實際上為連鎖的可能性;這個比率的10作底的對數就是對數優勢比。為了確定兩對基因之間是否存在連鎖,一般要求或然比大於1000:1,即Lod>3;而要否定連鎖存在,則要求或然小於1:100,即Lod<-2。
通常判定連鎖關係是以Lod值大小為依據。Lod值為0,意味著連鎖假設與不連鎖假設的可能性相等;Lod值為正值,有利於連鎖;Lod值為負值,表示有一定重組率的連鎖。顯著的域值是+3和-2。Lod=+3時,連鎖的概率為95%。