表達序列標籤
表達序列標籤
表達序列標籤從互補DNA(cDNA)分子所測得部分序列的短段DNA(通常300~500bp)。從cDNA文庫所得到的許多表達序列標籤集合組成表達序列標籤資料庫,代表在一定的發育時期或特定的環境條件下,特定的組織細胞基因表達的序列。可用於驗證基因在特定組織中的表達,推導全長cDNA序列,或作為標籤標誌基因組中的特殊位點以確定基因的位置等。
隨選擇 隆’端’端單測序獲短 序列,完整基,據庫般 ,均 ± 。 源環境組織mRNA 所構建的cDNA 文庫,因此EST也能說明該組織中各基因的表達水平。
首品組織提取 ,逆轉錄酶 ( ) 引 - 合 ,選擇合適載構建 庫,各菌株整,菌株插片段根據載隆設計引端化測序, 序列產程。
達基區域標籤編碼DNA 序列高度保守而具有自身的特殊性質,與來自非表達序列的標記(如AFLP、RAPD、SSR 等) 相比更可能穿越家系與種的限制,因此EST標記在親緣關係較遠的物種間比較基因組連鎖圖和比較質量性狀信息是特別有用。同樣,對於一個DNA 序列缺乏的目標物種,來源於其他物種的EST也能用於該物種有益基因的遺傳作圖,加速物種間相關信息的迅速轉化。具體說,EST的作用表現在:
(1) 用於構建基因組的遺傳圖譜與物理圖譜;
(2) 作為探針用於放射性雜交;
(3) 用於定位克隆;
(4) 藉以尋找新的基因;
(5) 作為分子標記;
(6) 用於研究生物群體多態性;
(7) 用於研究基因的功能;
(8) 有助於藥物的開發、品種的改良;
(9) 促進基因晶元的發展等方面。正是因為EST 表現出了這些巨大潛能,使其得到了充分的利用與發展。