魏景元四年(263年),曹魏滅蜀漢后，分益州的廣漢、巴、涪陵以北諸郡為梁州，涪陵郡屬之。西晉末還治涪陵縣。東晉成帝咸和元年(326年)、三年(328年),
成漢軍隊兩次進攻涪陵，晉太守或被擒或戰死，涪陵郡地區不為東晉所有。經過兩次進攻，涪陵郡建置廢於戰亂。
咸和三年(328年)以後不久，涪陵郡地就被當地少數民族首領控制。
晉穆帝永和三年(347年),桓溫平蜀。因涪陵故郡業已廢沒，東晉在巴郡的枳縣僑置涪陵郡，東晉後期還治涪陵縣。
南齊建元二年屬巴州。周保定四年涪陵等縣，郡治漢平縣（今郁山鎮），屬奉州。建德三年（574年），廢奉州置黔州涪陵郡屬之。隋開皇三年（583）廢涪陵郡。