生物信息學概論

本書介紹了生物學和計算機應用的基礎知識，提出了許多生物信息學的基本問題，闡述了生物信息學的基本分析方法。此外，本書還給出了許多實用演演算法和常式。

本書是一本優秀的生物信息學概論或導論教材，可作為生物信息學方向高年級本科生或研究生的入門教材。

孫嘯，男，教授，博士生導師，1962年生。曾經承擔多個國家自然科學金項目、國家863項目以及省部科研項目，主持研製出多個軟體系統。近年來發表論文40多篇。與他人合作出版專著2部，獲得發明專利1項。目前在東南大學生物科學與醫學工程系工作，主要從事生物信息學及基因晶元信息學研究工作。主講過多門課程，早在1999年就開設了“生物信息學”研究生課程。在人才培養方面，致力於工醫複合型人才的培養。曾經獲得江蘇省優秀研究生指導教師、江蘇省優秀碩士學位論文指導教師稱號。

第1章 分子生物學和生物化學

1.1 遺傳物質

1.2 基因結構和遺傳信息

1.3 蛋白質的結構與功能

1.4 化學鍵的本質

1.5 分子生物學工具

1.6 基因組信息

本章總結

閱讀資料

問題

第2章 資料庫搜索與兩兩對比

2.1 點陣圖

2.2 簡單比對

2.3 空位

2.4 打分矩陣

2.5 動態規劃：Needleman和Wunsch演演算法

2.6 全局對比與局部比對

2.7 資料庫搜索

2.8 多重序列比對

本章總結

閱讀資料

問題

第3章 替換模式

3.1 基因內的替換模式

3.2 估算替換數目

3.3 基因間進化率的變化

3.4 分子時鐘

3.5 細胞器的進化

本章總結

閱讀資料

問題

第4章 基於距離的系統發生分析

4.1 分子系統發生的歷史

4.2 分子系統發生分析的優點

4.3 系統發生樹

4.4 距離矩陣法

4.5 最大似然法

4.6 多重序列比對

本章總結

閱讀資料

問題

第5章 基於特徵的系統發生分析

第6章 基因組學和基本識別

第7章 蛋白質和RNA結構預測

第8章 蛋白質組學

附錄A 計算機編程和數據結構的簡介

附錄B 酶動力學

附錄C PERL程序舉例

辭彙表

部分問題的答案