新化縣衛生局現位於上渡辦事處財衛路1號，前身為縣人民政府衛生科，始設於1951年11月，是新化縣人民政府衛生行政主管部門。
衛生局現有辦公室、人事股、醫政科教股、
中醫藥管理股、計財股、衛生法制與監督股、防保股、紀檢監察室、縣愛衛辦、縣紅會辦、縣獻血辦、縣地病辦等12個職能股室。下屬單位39家，其中縣直醫療衛生單位10家，
鄉鎮衛生院29家。全系統共有在職幹部職工3210人，其中衛生技術人員2831人。有
村衛生室892個，個體開業行醫52人。鄉村醫生1188人，婦幼保健員1142人。局機關工作人員47人，其中局長1名、黨組書記1名、副局長5名、紀檢組長1名、系統工會主席1名、監察室主任1名。縣衛生局肩負著保障全縣134萬人民群眾身體身體的重任。