吳毅臻

2006年，吳毅臻進入申花足校接受專業足球訓練。

2011年，吳毅臻入選上海中邦並隨隊參加乙級聯賽，正式開啟職業之路。

上海上港

2013年1月，吳毅臻加盟剛剛升入中超聯賽的上海上港。2013年5月21日，在2013賽季中國足協杯第3輪上海上港6-5戰勝重慶當代力帆足球俱樂部的比賽中，吳毅臻獲得首發登場，完成個人在中國足協杯的處子秀。6月25日，在2013賽季中超聯賽第14輪上海上港0-1不敵廣州恆大淘寶足球俱樂部的比賽中，吳毅臻在第66分鐘替補呂文君登場，完成個人在中超聯賽的處子秀。2013賽季，吳毅臻代表上海上港出場3次，貢獻1次助攻。

上海申鑫

2014年1月，吳毅臻轉會加盟上海申鑫。2014年4月20日，在2014賽季中超聯賽第7輪上海申鑫0-0戰平江蘇蘇寧足球俱樂部的比賽中，吳毅臻獲得首發登場，完成個人在2014賽季的首次首發。2014賽季，吳毅臻代表上海申鑫出場15次，未取得進球及助攻。

2015年4月11日，在2015賽季中超聯賽第5輪上海申鑫1-2不敵石家莊永昌足球俱樂部的比賽中，吳毅臻在第62分鐘助攻丹尼爾·奇馬·楚庫破門，完成個人在2015賽季的首次助攻。5月16日，在2015賽季中超聯賽第10輪上海申鑫3-1戰勝廣州富力足球俱樂部的比賽中，吳毅臻在第89分鐘攻入一球，完成個人在中超聯賽的首粒進球。2015賽季，吳毅臻代表上海申鑫出場27次，攻入4粒進球並貢獻3次助攻，成為上海申鑫隊內本土射手王。

2016年3月13日，在2016賽季中甲聯賽首輪上海申鑫1-3不敵大連超越足球俱樂部的比賽中，吳毅臻獲得首發登場，完成個人在中甲聯賽的處子秀。3月20日，在2016賽季中甲聯賽第2輪上海申鑫2-0戰勝內蒙古中優足球俱樂部的比賽中，吳毅臻在第58分鐘攻入一球，完成個人在中甲聯賽的首粒進球。6月18日，在2016賽季中甲聯賽第14輪上海申鑫3-1戰勝湖南湘濤足球俱樂部的比賽中，吳毅臻分別在第53分鐘和第70分鐘助攻比羅比羅和楚庫破門，完成個人在助攻“梅開二度” 。2016賽季，吳毅臻代表上海申鑫出場28次，攻入3粒進球並貢獻7次助攻。

2017年4月1日，在2017賽季中甲聯賽第3輪上海申鑫0-0戰平浙江綠城足球俱樂部的比賽中，吳毅臻在替補柳超登場，完成個人在2017賽季的處子秀。8月26日，在2017賽季中甲聯賽第23輪上海申鑫2-2戰平梅州客家足球俱樂部的比賽中，吳毅臻在第33分鐘助攻克萊頓·席爾瓦破門，完成個人在2017賽季的首次助攻。2017賽季，吳毅臻代表上海申鑫出場12次，貢獻2次助攻。

2018年4月1日，在2018賽季中甲聯賽第3輪上海申鑫4-3戰勝浙江綠城的比賽中，吳毅臻在87分鐘攻入致勝一球，完成個人在2018賽季的首粒進球。5月19日，在2018賽季中甲聯賽第13輪上海申鑫4-3戰勝遼寧宏運足球俱樂部的比賽中，吳毅臻分別在第21分鐘和第77分鐘攻入兩球上演“梅開二度”，完成個人在2018賽季的首個“梅開吳毅臻加盟上海綠地申花(3張)二度” 。2018賽季，吳毅臻代表上海申鑫出場29次，攻入8粒進球並貢獻3次助攻。

上海綠地申花

2018年12月11日，經過上海綠地申花與上海申鑫協商並達成一致，吳毅臻正式加盟上海綠地申花。

2019年4月27日，在2019賽季中超第7輪上海綠地申花2-3不敵天津天海足球俱樂部的比賽中，吳毅臻在第73分鐘攻入一球，完成個人2019賽季的首粒進球。6月14日，在2019賽季中超第13輪上海綠地申花1-2不敵北京中赫國安足球俱樂部的比賽中，吳毅臻在第90分鐘攻入一球，完成個人賽事的第二進球。2019賽季，吳毅臻代表上海綠地申花出場13次，攻入2粒進球。

武漢三鎮

徠2020年8月5日，武漢三鎮官宣，吳毅臻由上海綠地申花足球俱樂部租借加盟。

吳毅臻身體素質出色，速度快，得分能力強。