孔子鳥科

界：動物界 Animalia

門：脊索動物門 Chordata

綱：鳥綱 Aves

目：孔子鳥目 Confuciusornithiformes

Hou et al., 1995

科：孔子鳥科 Confuciusornithidae

Hou et al., 1995

此科內共有4屬7種：

孔子鳥屬Confuciusornis

聖賢孔子鳥Confuciusornis sanctus

杜氏孔子鳥Confuciusornis dui

費氏孔子鳥 Confuciusornis feducciai

長城鳥屬Changchengornis

橫道長城鳥Changchengornis hengdaoziensis

錦州鳥屬 Jinzhouornis

義縣錦州鳥 Jingzhouornis yixianensis

張吉營錦州鳥 Jingzhouornis zhangjiyingia

始孔子鳥屬 Eoconfuciusornis

鄭氏始孔子鳥 Eoconfuciusornis zhengi

其中，鄭氏始孔子鳥比其他孔子鳥科鳥類早出現1100萬年。

孔子鳥科由侯連海等人（Hou et al.）於1995年命名，包含模式屬孔子鳥屬，並被劃分至鳥綱孔子鳥目。這一類群由Chiappe於1999年給出了種系發生學定義，他將基於節點的分支孔子鳥科（Confuciusornithidae）定義為只包含長城鳥和孔子鳥的一科。Sereno這一定義擴大，將所有親緣關係與聖賢孔子鳥（Confuciusornis sanctus）更近、與家麻雀（Passer domesticus）相對較遠的物種都包含在孔子鳥科中。錦州鳥由侯連海、周忠和及張福成於2002年被加至孔子鳥科，而始孔子鳥由張福成、周忠和及邁克爾·本頓於2008年被歸入孔子鳥科。

藝術家對始孔子鳥的藝術猜想，描繪出其成對的尾羽大約半數的保留有羽毛的孔子鳥科（包括所有物種的代表種）標本都擁有一對與眾不同的絲帶狀尾羽，而且羽毛既可能是有羽軸的正羽，也可能是不帶羽軸的絨羽。