質量分析器的質譜儀的重要組成部件，位於離子源和檢測器之間，依據不同方式將離子源中生成的樣品離子按質荷比m/z的大小分開。
磁分析器
質量分析器
包括單聚焦型和雙聚焦型。經加速后的
離子束在磁場作用下飛行軌道發生不同程度的彎曲而分離。雙聚焦質譜儀的解析度可達150000；
飛行時間分析器
飛行時間分析器被加速的離子按不同的的時間經漂移管到達收集極上而分離；
四極濾質器
可以快速地進行全掃描，適合與相色譜儀聯用；
離子阱和離子迦旋共振分析器
前者結構簡單，易於操作，已用於與
氣相色譜儀聯用，分析m/z為200-2000的分子；後者用於
傅里葉變換質譜儀上，掃描速率快，解析度高，能獲得較大
相對分子質量的信號。
