福建省農業科學院中心實驗室成立於1983年,1989年列為“福建省精密儀器農業測試重點公共實驗室”,1991年由省海洋與漁業局、省質量技術監督局授權在本室內設立“福建省水產飼料質量監督檢驗站”,並於同年通過福建省檢驗機構計量認證/審查認可實驗室,是完全獨立的第三方公正檢驗機構。
本室設技術科、質量管理科、綜合業務科、科管科、檢測室(光譜、
色譜、化學、
微生物)、分子生物研究室等科室。現有在職職工32人,其中專業技術人員27人,占職工總數的84%;高級專業技術人員12人,中級專業人員9人,省級專家1人,省百千萬人才2名。