酶切位點
酶切位點
酶切位點(Restriction Enzyme cutting site):DNA上一段鹼基的特定序列,限制性內切酶能夠識別出這個序列並在此將DNA序列切成兩段。
可能存在同尾酶,不同酶的識別序列不同,有的可能能識別多個酶切位點比如STY1識別序列有WW。
目錄
不同內切酶對識別位點以外最少保護鹼基數目的要求(在本表中沒有列出的酶,則通常需在識別位點兩端至少加上6個保護鹼基,以確保酶切反應的進行。)
酶 | 寡核苷酸序列 | 鏈長 | 切割率% | |
2 hr | 20 hr | |||
Acc I | GGTCGACC CGGTCGACCG CCGGTCGACCGG | 8 10 12 | ||
Afl III | CACATGTG CCACATGTGG CCCACATGTGGG | 8 10 12 | >90 >90 | >90 >90 |
Asc I | GGCGCGCC AGGCGCGCCT TTGGCGCGCCAA | 8 10 12 | >90 >90 >90 | >90 >90 >90 |
Ava I | CCCCGGGG CCCCCGGGGG TCCCCCGGGGGA | 8 10 12 | 50 >90 >90 | >90 >90 >90 |
BamH I | CGGATCCG CGGGATCCCG CGCGGATCCGCG | 8 10 12 | 10 >90 >90 | 25 >90 >90 |
Bgl II | CAGATCTG GAAGATCTTC GGAAGATCTTCC | 8 10 12 | 75 25 | >90 >90 |
BssH II | GGCGCGCC AGGCGCGCCT TTGGCGCGCCAA | 8 10 12 | 50 | >90 |
BstE II | GGGT(A/T)ACCC | 9 | 10 | |
BstX I | AACTGCAGAACCAATGCATTGG AAAACTGCAGCCAATGCATTGGAA CTGCAGAACCAATGCATTGGATGCAT | 22 24 27 | 25 25 | 50 >90 |
Cla I | CATCGATG GATCGATC CCATCGATGG CCCATCGATGGG | 8 8 10 12 | >90 50 | >90 50 |
EcoR I | GGAATTCC CGGAATTCCG CCGGAATTCCGG | 8 10 12 | >90 >90 >90 | >90 >90 >90 |
Hae III | GGGGCCCC AGCGGCCGCT TTGCGGCCGCAA | 8 10 12 | >90 >90 >90 | >90 >90 >90 |
Hind III | CAAGCTTG CCAAGCTTGG CCCAAGCTTGGG | 8 10 12 | 10 | 75 |
Kpn I | GGGTACCC GGGGTACCCC CGGGGTACCCCG | 8 10 12 | >90 >90 | >90 >90 |
Mlu I | GACGCGTC CGACGCGTCG | 8 10 | 25 | 50 |
Nco I | CCCATGGG CATGCCATGGCATG | 8 14 | 50 | 75 |
Nde I | CCATATGG CCCATATGGG CGCCATATGGCG GGGTTTCATATGAAACCC GGAATTCCATATGGAATTCC GGGAATTCCATATGGAATTCCC | 8 10 12 18 20 22 | 75 75 | >90 >90 |
Nhe I | GGCTAGCC CGGCTAGCCG CTAGCTAGCTAG | 8 10 12 | 10 10 | 25 50 |
Not I | TTGCGGCCGCAA ATTTGCGGCCGCTTTA AAATATGCGGCCGCTATAAA ATAAGAATGCGGCCGCTAAACTAT AAGGAAAAAAGCGGCCGCAAAAGGAAAA | 12 16 20 24 28 | 10 10 25 25 | 10 10 90 >90 |
Nsi I | TGCATGCATGCA CCAATGCATTGGTTCTGCAGTT | 12 22 | 10 >90 | >90 >90 |
Pac I | TTAATTAA GTTAATTAAC CCTTAATTAAGG | 8 10 12 | 25 >90 | |
Pme I | GTTTAAAC GGTTTAAACC GGGTTTAAACCC AGCTTTGTTTAAACGGCGCGCCGG | 8 10 12 24 | 75 | 25 50 >90 |
Pst I | GCTGCAGC TGCACTGCAGTGCA AACTGCAGAACCAATGCATTGG AAAACTGCAGCCAATGCATTGGAA CTGCAGAACCAATGCATTGGATGCAT | 8 14 22 24 26 | 10 >90 >90 | 10 >90 >90 |
Pvu I | CCGATCGG ATCGATCGAT TCGCGATCGCGA | 8 10 12 | 10 | 25 10 |
Sac I | CGAGCTCG | 8 | 10 | 10 |
Sac II | GCCGCGGC TCCCCGCGGGGA | 8 12 | 50 | >90 |
Sal I | GTCGACGTCAAAAGGCCATAGCGGCCGC GCGTCGACGTCTTGGCCATAGCGGCCGCGG ACGCGTCGACGTCGGCCATAGCGGCCGCGGAA | 28 30 32 | 10 10 | 50 75 |
Sca I | GAGTACTC AAAAGTACTTTT | 8 12 | 10 75 | 25 75 |
Sma I | CCCGGG CCCCGGGG CCCCCGGGGG TCCCCCGGGGGA | 6 8 10 12 | 10 >90 | 10 10 50 >90 |
Spe I | GACTAGTC GGACTAGTCC CGGACTAGTCCG CTAGACTAGTCTAG | 8 10 12 14 | 10 10 | >90 >90 50 50 |
Sph I | GGCATGCC CATGCATGCATG ACATGCATGCATGT | 8 12 14 | 10 | 25 50 |
Stu I | AAGGCCTT GAAGGCCTTC AAAAGGCCTTTT | 8 10 12 | >90 >90 >90 | >90 >90 >90 |
Xba I | CTCTAGAG GCTCTAGAGC TGCTCTAGAGCA CTAGTCTAGACTAG | 8 10 12 14 | >90 75 75 | >90 >90 >90 |
Xho I | CCTCGAGG CCCTCGAGGG CCGCTCGAGCGG | 8 10 12 | 10 10 | 25 75 |
Xma I | CCCCGGGG CCCCCGGGGG CCCCCCGGGGGG TCCCCCCGGGGGGA | 8 10 12 14 | 25 50 >90 | 75 >90 >90 |