不等鞭毛門

不等鞭毛門（學名：Heterokontophyta）是真核生物的主線，已知的下轄物種超過10萬個品種，當中大多數屬於單細胞的硅藻綱。大至多細胞的大型海草，小至單細胞的各種浮遊硅藻。這些藻類擁有葉綠體。其他值得注意的成員還有寄生性的卵菌綱，是不少植物性瘟疫的元兇，如愛爾蘭馬鈴薯飢荒及近日的橡樹突然死亡，都是由卵菌綱生物引起的。

一、有色類 (藻類生物)

1、Actihrysophyceae (axodines)

2、硅藻綱（Bacillariophyceae）

3、Bolidophyceae

4、金藻綱（Chrysophyceae）

5、大眼藻綱(Eustigmatophyceae)

6、Pelagophyceae

7、褐藻綱（Phaeophyceae）

8、Phaeothamniophyceae

9、綠胞藻綱(Raphidophyte或Chloromonadophyceae)

10、Synurophyceae

11、黃綠藻綱（Xanthophyceae）

二、無色類 (真菌類生物)

1、Bicosoecea

2、絲壺菌綱(Hyphochytridiomycetes)

3、Labyrinthulomycetes (slime nets)

4、卵菌綱(Oomycetes)

5、Opalinea

6、Proteromonadea

7、芽囊原蟲綱（Blastocystis）