吳新源，男，漢族，1948年11月生，廣東恩平人，1969年2月參加工作，1969年1月加入中國共產黨，學歷中央黨校大學（中央黨校經濟管理專業函授本科）。
1969年1月後，廣東省梅縣軍分區戰士、班長、排長、軍事教員、參謀；
1974年後，任廣東省軍區司令部辦公室秘書，民兵組織處、動員處參謀；
1983年後，任廣東省軍區民兵預備役訓練處副處長、處長；
1993年後，任河源軍分區司令員，河源市委常委、河源市人大常委會委員（其間：1994.09～1997.02在中央黨校經濟管理專業函授本科學習）；
2001年後，任廣州市委常委、廣州警備區司令員。
省九屆人大代表，第七屆市委委員。