1912年6月1日，正值清末民初，西風東漸，現代醫學開始進入中國。懷著醫學救國的信念和熱誠，留日學者韓清泉等在杭州創辦了浙江醫學專門學校，從而開啟了中國自辦高等醫學教育的先河。其後屢經變遷，1952年，浙江醫學專門學校與創設於1945年的國立浙江大學醫學院合併為浙江醫學院，1960年升格為浙江醫科大學。1998年，與浙江大學、杭州大學、浙江農業大學合併成立新的浙江大學，並於次年重組成立了浙江大學醫學院和藥學院。2009年浙江大學實行大部制，將醫學院和藥學院重組，成立浙江大學醫學部。2014年浙江大學實施學部制優化改革，醫學部更名為醫藥學部，醫學院和藥學院獨立建院。
