離子交換層析法(Ion Exchange Chromatography簡稱為IEC)是以離子交換劑為固定相，依據流動相中的組分離子與交換劑上的平衡離子進行可逆交換時的結合力大小的差別而進行分離的一種層析方法。常用的離子交換劑有：離子交換纖維素、離子交換葡聚糖和離子交換樹脂。
離子交換層析法中，基質是由帶有電荷的樹脂或纖維素組成。帶有正電荷的稱之
陰離子交換樹脂；而帶有負電荷的稱之陽離子樹脂。離子交換層析同樣可以用於蛋白質的分離純化。由於蛋白質也有等電點，當蛋白質處於不同的
pH條件下，其帶電狀況也不同。陰離子交換基質結合帶有負電荷的蛋白質，所以這類蛋白質被留在柱子上，然後通過提高洗脫液中的鹽濃度等措施，將吸附在柱子上的蛋白質洗脫下來。
