親和層析是將具有特殊結構的親和分子製成固相吸附劑放置在層析柱中，當要被分離的蛋白混合液通過層析柱時，與吸附劑具有親和能力的蛋白質就會被吸附而滯留在層析柱中。那些沒有親和力的蛋白質由於不被吸附，直接流出，從而與被分離的蛋白質分開，然後選用適當的洗脫液，改變結合條件將被結合的蛋白質洗脫下來，這種分離純化蛋白質的方法稱為親和層析。
Affinity Chromatography親合色譜分析法（親合層析法）,利用靜電(electrostatic)作用，疏水(hydrophobic)作用或者氫鍵（Van der Waals）連接目標蛋白質與特異配體(specific ligand)還有層析介質，再通過加入互補特意配體或者改變PH；溶液離子濃度；極性，逆向反應，從而分離洗提蛋白質，提純。