組織控制，為實現組織的目標而進行的組織結構設計、權責安排和制度設計。
在信息技術環境下，流程決定企業的組織結構。因此，組織結構設計應以產出為中心，結合企業流程特點、信息化程度、人員素質、風險類型與大小進行全盤考慮；圍繞產出目標，重新審視原先組織的職能界限與任務劃分，儘可能將跨越不同職能部門並由不同專業人員完成的工作環節集合起來，形成適應
流程管理與控制的企業組織結構，使企業
組織設計能保障決策點、控制點位於工作執行的地方，能將信息處理工作納入產生這些信息的實際工作中，並與員工信息的使用權、決策權相匹配，與切合流程職位的控制信息需求和成功運用這些信息相匹配。
組織控制的功能主要有三個：
(1)規定每個人的責任；
(2)規定各成員之間的關係；
(3)調動組織內每個成員的積極性