南京工程學院環境工程學院成立於2007年，其前身依託於我院辦學歷史悠久的優勢學科-能源與動力學科，著眼於電力環保以及城市和城鎮水、氣、聲、固體廢物等污染防治、給排水工程、水污染控制規劃和水資源保護等。目前學院建有23個專業實驗室，6個專業實習基地，具有良好的教學實踐條件。目前設有環境工程和水質科學與技術，能源化學工程三個專業，其中環境工程專業是江蘇省重點建設學科，包括四個專業方向（環境工程、水質科學與技術，電力環保以及能源化學工程）。
本學科師資力量雄厚，擁有一支學術水平高，教學質量高的教師隊伍。有專職教師20人，其中正副教授10人，占教師總數50%，博士碩士教師19人，入選江蘇省“
333工程”2人，江蘇省“
青藍工程”3人。35周歲以下教師中具有研究生及以上學位的比例為100%。