生化標誌物是可以用生物化學試驗檢出的任何特異性狀或物質。如特定酶的存在或缺失、特定的激素濃度、特定的代謝產物、生物物質等。可用做生物科學研究、衡量生理或病理狀態、疾病診斷或預后判斷、環境監測的標誌。代謝產物指新陳代謝中的中間代謝產物和最終代謝產物。
如某些代謝產物
乳酸、
乙醇，
抗生素等是某些
微生物在特殊代謝條件下的中間代謝產物。因此掌握有關代謝規律和條件，有利於這些產品的生產。但並非所有物質均如此，如
蛋白質代謝產物為水，
二氧化碳，
尿素。最終產物；水，二氧化碳，含氮廢物(如尿素)相關過程：
氨基酸→
多肽→
蛋白質蛋白質→氨基酸→水，二氧化碳，含氮廢物(如尿素)氨基酸來自食物，或者是氨基酸之間的轉化。