甬台溫鐵路溫州境內車站站名2009年9月20日確定，位於甌海區潘橋鎮的火車站，正式命名為溫州南站，以跟原有的金溫鐵路溫州站有所區分。位於甌海區潘橋鎮的火車站在建設過程中，有稱新火車站，也有稱甬台溫鐵路溫州站的，現在甬台溫鐵路開通在即，如果還稱新溫州站或者溫州站，與原有的金溫鐵路溫州站容易引起混淆，因此根據其在溫州市區的地域方位，定為溫州南站。
但在建設過程中，在潘橋鎮南面，距新火車站約4公里處，已經有一個貨運站稱溫州南站，本次改名時，該南站也得跟著改名為甌海站。另外，
樂清的紳紡站，改成與當地村名同樣的
紳坊站。這樣一來，甬台溫鐵路在溫州境內的站，從北到南依次為雁盪站、紳坊站、
樂清站、
永嘉站、溫州南站、甌海站（貨運站）；再延伸到
溫福鐵路，就是
瑞安站、
鰲江站、
蒼南站。