清光緒二十七年(1901)成立全國總商會。1921年曹為仙發起組織南京市商民協會籌備處。1927年9月申請成立市商民協會。經南京市黨部、市政府許可立案。1928年6月，南京市黨部組織商會整理委員會。1929年2月市商會整理委員會對
商民協會進行整理，9月成立了商人、店員、攤販三個總會。1930年12月組織南京市商會籌備會。1931年4月成立南京市商會。
1933年進行改組。1936年8月再次改組后正式成立南京市商會。市商會執行委員有汪權梅、江政卿、王繹齋、李富前、柳鎔紳、端木申卿、胡庸山、趙連成、張竟平、杜哲庵、江雲程、錢貫之、穆華軒、游竹蓀、葛亮疇，監察委員有黃同軒、王光祖、宓公幹、羅納齋、王公瞍、程紹余、於芮松，候補執行委員有
陳錫生、王卓之、王瑞梧、岳碹、竺建甫、程嘉農、馮魯蟾，候補監察委員有
陳漢卿、陳家禮、呂蒼岩。公會會員有76個團體，商店會員有3個。會址設在南京白下路。1946年4月25日在南京改組成立。負責人為王繹齋。同年6月18日經南京市社會局核准立案。會址仍設在南京白下路。