DNA印跡技術是研究DNA圖譜的基本技術，在遺傳診斷DNA圖譜分析及PCR產物分析等方面有重要價值。基本方法是將DNA標本用限制性內切酶消化后，經瓊脂糖凝膠電泳分離各酶解片段，然後經鹼變性，Tris緩衝液中和，高鹽下通過毛吸作用將DNA從凝膠中轉印至硝酸纖維素濾膜（尼龍膜也較長用）上，烘乾固定后即可用於雜交。
凝膠中DNA片段的相對位置轉移到濾膜的過程中繼續保持著。附著在濾膜上的DNA與32P標記的探針雜交，利用放射自顯影術確定探針互補的每條DNA帶的位置，從而可以確定在眾多酶解產物中含某一特定序列的DNA片段的位置和大小。