核鹼基（英語：Nucleobase）是指一類含氮鹼基（nitrogenous base），在生物學上通常簡單地稱之鹼基（base）。是在DNA和RNA中，起配對作用的部分。核鹼基都是雜環化合物，其氮原子位於環上或取代氨基上，其中一部分（取代氨基，以及嘌呤環的1位氮、嘧啶環的3位氮）直接參與鹼基配對。
常見的核鹼基共有5種：
胞嘧啶（縮寫C）、鳥嘌呤（G）、
腺嘌呤（A）、
胸腺嘧啶（T，通常為DNA專有）和尿嘧啶（U，通常為RNA專有）。腺嘌呤和鳥嘌呤屬於嘌呤族（縮寫作R），它們具有雙環結構。胞嘧啶、
尿嘧啶、胸腺嘧啶屬於嘧啶族（Y），它們的環系是一個六元雜環。RNA中，尿嘧啶取代了胸腺嘧啶的位置。胸腺嘧啶比尿嘧啶多一個5位甲基，這個甲基增大了遺傳的準確性。
鹼基通過磷酸雙酯鍵與核糖或脫氧核糖的1位碳原子相連而形成的化合物叫
核苷。核苷再與磷酸結合就形成
核苷酸，磷酸基接在五碳糖的5位碳原子上。
