台灣水師協設置於1684年,為台灣清治時期的海上軍事編製。隸屬於台灣鎮的台灣水師協設有中、左、右三營,掌管全台灣海防,連守港兵士共約有兩千名,內地按班撥戍,餉有定額。以同治之後的編製而論,設置總部於安平汛的台灣水師共有約五六十艘戰船,且掌管炮台十數座。另外,該協主管為副將,所轄各營設有參將、游擊等軍事將領。
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