化學滅菌法是指用化學藥品直接作用於微生物而將其殺死的方法。
對微生物具有殺滅作用的化學藥品稱為殺菌劑，可分為氣體滅菌劑和液體滅菌劑。殺菌劑僅對微生物繁殖體有效，不能殺滅芽孢。化學殺菌劑的殺滅效果主要取決於微生物的種類與數量，物體表面的光潔度或多孔性以及殺菌劑的性質等。化學滅菌的目的在於減少微生物的數目，以控制一定的無菌狀態。
化學滅菌法可分為氣體滅菌法和液體滅菌法。
甲醛滅菌器
1. 氣體滅菌法 是指採用氣態殺菌劑（如
臭氧、
環氧乙烷、
甲醛、
丙二醇、
甘油和
過氧乙酸蒸汽等）進行
滅菌的方法。該法特別適合環境消毒以及不耐加熱滅菌的醫用器具、設備和設施的消毒。臨床供應商常用到的環氧乙烷低溫滅菌器、過氧化氫等離子體滅菌器、低溫蒸汽
甲醛滅菌器都是這中方法。亦可用於粉末注射劑，但不適合於對
產品質量有損害的場合。 2. 液體滅菌法 是指採用殺菌劑容易如進行消毒的方法。該法常作為其他
滅菌法的輔助措施，適合於皮膚、無菌器具和設備的消毒。常採用的
消毒液有75%
乙醇、1%
聚維酮碘溶液、0.1%~0.2%苯扎溴銨（新潔爾滅）、2%左右的酚或
煤酚皂溶液等。