免疫沉澱法

個別免疫沉澱法(IP)：用來分離某個細胞萃取物中的已知特定蛋白質

免疫共沉澱法(Co-IP)：研究整個蛋白質複合體

染色質免疫沉澱法(ChIP)：用來研究DNA上的特定蛋白質

RNA免疫沉澱法(RIP)：和ChIP相近，但RNA免疫沉澱法是用來研究會與RNA結合的蛋白質

RIP技術（RNA Binding Protein Immunoprecipitation，RNA結合蛋白免疫沉澱），是研究細胞內RNA與蛋白結合情況的技術，是了解轉錄后調控網路動態過程的有力工具，能幫助我們發現miRNA的調節靶點。RIP這種新興的技術運用針對目標蛋白的抗體把相應的RNA-蛋白複合物沉澱下來，然後經過分離純化就可以對結合在複合物上的RNA進行分析。RIP可以看成是普遍使用的染色質免疫沉澱ChIP技術的類似應用，但由於研究對象是RNA-蛋白複合物而不是DNA-蛋白複合物，RIP實驗的優化條件與ChIP實驗不太相同（如複合物不需要固定，RIP反應體系中的試劑和抗體絕對不能含有RNA酶，抗體需經RIP實驗驗證等等）。RIP技術下游結合microarray技術被稱為RIP-Chip，幫助我們更高通量地了解癌症以及其它疾病整體水平的RNA變化。

Millipore基於磁珠的RIP實驗流程

RIP 實驗基本原理：

1. 用抗體或表位標記物捕獲細胞核內或細胞質中內源性的RNA結合蛋白。

2. 防止非特異性的RNA的結合。

3. 免疫沉澱把RNA結合蛋白及其結合的RNA一起分離出來。

4.結合的RNA序列通過microarray（RIP-Chip），定量RT-PCR或高通量測序（RIP-Seq）方法來鑒定。