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Bootstrap

進化樹

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即自展值,是用來檢驗你所計算的進化樹分支可信度的。簡單地講就是把序列的位點都重排,重排后的序列再用相同的辦法構樹,如果原來樹的分枝在重排后構的樹中也出現了,就給這個分枝打上一分,如果沒出現就給0分,這樣經過你給定的repetitions次(至少1000次)重排構樹打分后,每個分枝就都得出分值,計算機會給你換算成bootstrap值。重排的序列有很多組合,值越小說明分枝的可信度越低,最好根據數據的情況選用不同的構樹方法和模型。