由歐洲生物信息學研究所(EBI)維護，經過註釋的蛋白質序列資料庫。
SWISS-PROT是經過註釋的蛋白質序列資料庫，由歐洲生物信息學研究所(EBI)維護。
資料庫由蛋白質序列條目構成，每個條目包含蛋白質序列、引用文獻信息、
分類學信息、註釋等，註釋中包括蛋白質的功能、轉錄后修飾、特殊位點和區域、
二級結構、四級結構、與其它序列的相似性、序列殘缺與疾病的關係、序列變異體和衝突等信息。SWISS-PROT中儘可能減少了冗餘序列，並與其它30多個數據建立了
交叉引用，其中包括核酸序列庫、蛋白質序列庫和
蛋白質結構庫等。利用序列提取系統(
SRS)可以方便地檢索SWISS-PROT和其它EBI的資料庫。SWISS-PROT只接受直接測序獲得的蛋白質序列，序列提交可以在其Web頁面上完成。