曹孟籍

曹孟籍

曹孟籍,博士,西南大學/中國農科院柑桔研究所副研究員,碩士生導師,現任國際柑桔病毒學家組織(IOCV)秘書長

基本介紹


教育和研究經歷:
2007年6月,西南大學植物保護學院,植物保護學士學位
2012年12月,西南大學植物保護學院/中國農科院柑桔研究所,植物病理學博士學位;
2010年至2014年,加州大學河濱分校(UCR),博士聯合培養和博士后研究;
2014年至2015年,美國農業部國家種質資源研究實驗室(USDA-ARS-NGRL),博士后研究;
2013年1月至,西南大學/中國農科院柑桔研究所國家柑桔苗木脫毒中心工作。
主持國家自然基金、國家重點研發中歐政府間合作項目課題(柑桔苗木無病毒化研究)、農業部植保專項、重慶市基礎科學與前沿技術研究重點項目、中央高校基本科研業務費重點項目和西南大學科技新星一等資助等項目。
主要開展果樹(柑桔)病毒病和類似病毒病相關研究工作,同時致力於深度測序挖掘新病毒生物信息學分析和植物病毒與寄主互作分子機理的相關研究。以第一作者或通訊作者身份發表SCI論文10餘篇,主要包括PNAS,Frontiers in Microbiology,Plant Disease,Virus Research,Archives of Virology,EJPP等雜誌。多次受邀擔任國際刊物的審稿人。
代表性SCI期刊論文:
(1) Mengji Cao#, Peng Du#, Xian-Bing Wang, Yun-qi Yu, Yan-hong Qiu, Wan-Xiang Li, Amit Gal-On, Changyong Zhou, Yi Li and Shou-Wei Ding. Virus infection triggers widespread silencing of host genes by a distinct class of endogenous siRNAs in Arabidopsis, PNAS, 2014, 111: 14613-14618. (#Co-first author)
(2) Qingfa Wu, Ying Wang, Mengji Cao, Vitantonio Pantaleo, Joszef Burgyan, Wan-Xiang Li and Shou-Wei Ding. Homology-independent discovery of replicating pathogenic circular RNAs by deep sequencing and a new computational algorithm, PNAS, 109, 3938-3943, March 2012.
2018年:
(3) Ping Li, Min Li, Song Zhang, Fangyun Yang, Mengji Cao*, Zhongan Li. Complete genome sequences of four isolates of Citrus leaf blotch virus from citrus in China. Journal of Integrative Agriculture. 2018. (*Co-corresponding author)
(4) Song Zhang, Pan Shen, Min Li, Xin Tian, Changyong Zhou*, Mengji Cao*. Discovery of a novel geminivirus associated with camellia chlorotic dwarf disease. Archives of Virology. 2018. (*Co-corresponding author)
2017年:
(5) Pan Shen, Xin Tian, Song Zhang, Fang Ren, Ping Li,Yun-qi Yu, Ruhui Li, Changyong Zhou, * and Mengji Cao*. Molecular characterization of a novel luteovirus infecting apple by next-generation sequencing. Archives of Virology. 2017. (*Co-corresponding author)
(6) Min Xin,Mengji Cao*, Wenwen Liu,Yingdang Ren,Xueping Zhou andXifeng Wang*. Two negative-strand RNA viruses identified in watermelon represent a novel clade in the order Bunyavirales. Frontiers in Microbiology, 2017, 8:1514. doi: 10.3389/fmicb.2017.01514. (*Co-corresponding author)
(7) Mengji Cao, Pingxiu Lan, Fan Li, Jorge Abad, Changyong Zhou and Ruhui Li. Genome characterization of sweet potato symptomless virus 1: a mastrevirus with an unusual nonanucleotide sequence. Archives of Virology. 2017.
(8) Xin Tian, Yan Tian, Yun-qi Yu, Xuefeng Wang, Zhongan Li, Ruhui Li, Mengji Cao* and Changyong Zhou*. Periwinkle: A New Natural Host of Lettuce Chlorosis Virus in China. Plant Disease. 2017. (*Co-corresponding author)
(9) Mengji Cao, Qiong Wu, Fangyun Yang, Xuefeng Wang, Ruhui Li, Changyong Zhou and Zhongan Li. Molecular characterization and phylogenetic analysis of Citrus viroid VI variants from citrus in China. European Journal of Plant Pathology. 2017.
(10) Mengji Cao, Yunqi Yu, Xin Tian, Hongming Chen, Fangyun Yang and Changyong Zhou. First Report of Citrus leaf blotch virus on Citrus in China. Plant Disease. 2017.
(11) Yunqi Yu, Qiong Wu, Huanan Su, Mengji Cao* and Changyong Zhou*. Small RNA deep sequencing reveals full-length genome of Citrus yellow vein clearing virus in Chongqing, China. Journal of Integrative Agriculture. 2017, 16: 503-508. (*Co-corresponding author)
(12) Min Xin, Mengji Cao, Wenwen Liu, Yingdang Ren, Chuantao Lu and Xifeng Wang. The genomic and biological characterization of Citrullus lanatus cryptic virus infecting watermelon in China. Virus Research. 2017, 232: 106-112.
(13) Min Xin, Peipei Zhang, Wenwen Liu, Yingdang Ren, Mengji Cao and Xifeng Wang. The complete nucleotide sequence and genome organization of a novel betaflexivirus infecting Citrullus lanatus. Archives of Virology. 2017.
(14) Peipei Zhang,Yan Liu,Wenwen Liu,Mengji Cao,Sebastien Massart andXifeng Wang1. Identification, Characterization and Full-Length Sequence Analysis of a Novel Polerovirus Associated with Wheat Leaf Yellowing Disease. Frontiers in Microbiology, 2017.
(15) Yan Zhou, Hongming Chen, Mengji Cao, Xuefeng Wang, Xin Jin, Kehong Liu and Changyong Zhou. Occurrence, distribution and molecular characterization of Citrus yellow vein clearing virus in China. Plant Disease. 2017, 101: 137-143.
2017年以前:
(16) Mengji Cao, Q. Wu, S Atta, HN Su, YQ Yu, HM Chen, CY Zhou. First molecular evidence of Citrus yellow vein clearing virus from Citrus in Punjab, Pakistan. Plant Disease. 2016.
(17) Aijun Huang, Zhen Song, Mengji Cao, Hongming Chen, Zhongan Li and Changyong Zhou. The complete genome sequence of Citrus vein enation virus from China. Journal of Integrative Agriculture. 14, 598-601, March, 2015.
(18) Qiong Wu#, Mengji Cao#, Hunan Su, Sagheer Atta, Fangyun Yang, Xuefeng Wang and Changyong Zhou. Molecular characterization and phylogenetic analysis of Citrus viroid I-LSS variants from citrus in Pakistan and China reveals their possible geographic origin, European Journal of Plant Pathology, 2014. (#Co-first author)
(19) Mengji Cao, Huanan Su, Sagheer Atta, Xuefeng Wang, Qiong Wu, Zhongan Li and Changyong Zhou. Molecular characterization and Phylogenetic analysis of Citrus viroid V (CVd-V) isolates from citrus in Pakistan, European Journal of Plant Pathology, 135, 11-21, January 2013.
(20) Sagheer Atta, Changyong Zhou, Yan Zhou and Mengji Cao. Distribution and research advances of Citrus tristeza virus, Journal of Integrative Agriculture, 11, 346-358, March 2012.
(21) Mengji Cao, Yongqing Liu, Xuefeng Wang, Fangyun Yang and Changyong Zhou. First report of Citrus bark cracking viroid and Citrus viroid V infecting citrus in China, Plant Disease, 94, 922, July 2010.
(22) Xuefeng Wang, Yan Zhou, Zhongan Li, Kezhi Tang, Yongqing Liu, Mengji Cao and Changyong Zhou. Molecular, biological and phylogenetic analysis of chinese isolates of Hop stunt viroid associated with citrus cachexia disease. Journal of Phytopathology, 158, 372-377, May 2010.