薛宇

2002.7獲中國科學技術大學高分子科學與工程學士學位

2003.7獲中國科學技術大學計算機科學與技術雙學士學位

2007.1獲中國科學技術大學細胞生物學博士學位

2007.1-2007.7 中國科學技術大學，研究助理

2007.7-2009.7 中國科學技術大學生命科學學院系統生物學系，副教授

2009.7-現在，華中科技大學生命科學與技術學院

2013年6月應邀擔任國際期刊PLOS ONE的Academic Editor

2013年11月任國際期刊BMC Genomics的Associate Editor

蛋白質共價修飾的生物信息學，蛋白質-蛋白質相互作用網路的預測與重構，計算比較基因組學，以及功能位點的分子進化。一方面以共價修飾為主要研究對象，設計相應的計算方法，開發相關的計算軟體和資料庫，另一方面開展相應的實驗工作，以驗證計算結果的準確性。

主要研究方向為蛋白質共價修飾的生物信息學分析，近年來緊密圍繞共價修飾底物和位點預測、修飾調控分析以及修飾組學數據處理等重要科學問題，採用由點及面、層層推進的研究策略，取得了階段性的研究成果。

與合作者設計了新穎的GPS (Group-based Prediction System, 分組預測系統) 系列演演算法，構建了多種預測共價修飾底物和位點的計算工具、軟體和資料庫；

採用比較基因組學和統計學等方法，從蛋白質組層面系統分析了共價修飾潛在調控機制和功能，初步提出了本領域的標準化設計和分析流程；

結合磷酸化組學數據，初步揭示遺傳多樣性改變蛋白質共價修飾狀態，是其影響關鍵生物學過程和通路潛在分子機制；

利用乙醯化組學數據，初步模擬人類乙醯化調控網路，提出由乙醯轉移酶、底物和去乙醯酶組成的“三者關係”(Triplet relationship) 是構成人類乙醯化調控網路的基本單元。

學術論著

以主要作者 (第一或通訊) 身份發表SCI 收錄論文近40篇，被他人引用~700次。應邀為InTech 出版社“Bioinformatics - Experimental Biology Systems”一書撰寫一個章節。獲專利1項，軟體著作權4項

1. Xue Y*, Ren J*, Gao X, Jin C, Wen L, Yao X. (2008) GPS 2.0, a tool to predict kinase-specific phosphorylation sites in hierarchy. Molecular & Cellular Proteomics. 7: 1598-608.

2. Ren J, Jiang C, Gao X, Liu Z, Yuan Z, Jin C, Wen L, Zhang Z#, Xue Y#, Yao X#. (2009) PhosSNP: systematic analysis of genetic polymorphisms that influence protein phosphorylation. Molecular & Cellular Proteomics, (In press).

3. Fengfeng Zhou*, Yu Xue*, Xuebiao Yao, and Ying Xu. (2006) A general user interface for prediction servers of proteins' post-translational modification sites. Nature Protocols, 1(3), 1318-1321.

4. Yu Xue*, Fengfeng Zhou*, Minjie Zhu, Kashif Ahmed, Guoliang Chen, Xuebiao Yao. (2005) GPS: a comprehensive www server for phosphorylation sites prediction. Nucleic Acids Research, 33, W184-W187.

5. Ren J, Liu Z, Gao X, Jin C, Ye M, Zou H, Wen L, Zhang Z, Xue Y#, Yao X#. (2010) MiCroKit 3.0: an integrated database of midbody, centrosome and kinetochore. Nucleic Acids Research, 38, D155-60.

(*共同第一作者，#共同通訊作者)

獲國家自然科學基金、科技部和中國科學院等資助，獲計算軟體著作權登記證書四項。

主持及參與研究多項國家自然科學基金項目、中科院項目和科技部重大研究計劃項目

2006年獲香港"求是"研究生獎學金

2008獲“中國科學院優秀博士論文”獎

2012年獲“青年科學之星”銅獎