太田城是天仁年間（1108前後）由太田氏所築之城，當佐竹氏勢力抬頭后，太田城成為初代隆義的領地並被支配。應仁十四年（1407年），由於第十二代義盛無嫡子，因此佐竹氏由關東管領上杉憲定的次男龍保丸繼承，龍保丸成為佐竹氏第十三代當主。
太田城
築城年代 天仁年間
所在地 茨城縣常陸太田市中城町
築城者 太田氏
主要城主 太田氏、佐竹氏
城郭樣式 中世城館
在此同時，佐竹一族的山入氏開始反叛龍保丸，之後在百年後的永正元年（1504年），佐竹氏第十六代當主義舜才將山入氏攻滅，結束了宗家佐竹氏與山入氏的紛爭。到了第十八代當主義昭時，佐竹氏與
宇都宮氏結盟，並與
北關東的大名連合，組成反北條體制。到了十九代義重時，先後與白河、盧名、那須、北條敵對。當小田原之役結束后，在第二十代當主代義宜時，佐竹氏成為領有五十四萬石領地的近代大名，而太田城則成為義宜之父義重的居城，當主義宜並以
水戶城當做統治的據點。後來由於義宜在
關原合戰的
前哨戰討伐會津上杉之際反抗幕府，因此在
慶長七年（1602年）被移封至出羽秋田。