是眼蟲的一般生殖方式，也是鞭毛蟲綱的重要特徵之一。先是核進行有絲分裂，在分裂時核不消失，基體複製為二，繼之蟲體開始從前端分裂，鞭毛脫去，同時由基體再長出新的鞭毛。胞口也縱裂為二，然後繼續由前向後分裂，斷開成為兩個個體。
A.眼蟲縱二分裂；B.錐蟲縱二分裂
.蟲縱二裂；.錐蟲縱二裂
核絲裂，裂核消，基複製二，繼蟲始端裂，鞭毛脫，基鞭毛，保存鞭毛，另產鞭毛。胞縱裂二，繼續裂，斷。