輔酶II

輔酶II是光合作用中最重要的一種輔酶。通過氧化還原反應的形式傳遞質子、電子及能量，並且參與多種合成代謝反應，如脂類、脂肪酸和核苷酸的合成。這些反應中需要NADPH作為還原劑、氫負供體，NADPH是NADP+的還原形式。

植物葉綠體中，光合作用光反應電子鏈的最後一步中被還原為還原型輔酶Ⅱ（NADPH），此過程須經鐵氧還蛋白-NADP+還原酶的催化。反應剩餘一個質子（即氫離子），該質子與NADPH一起參加隨後的碳反應(暗反應)，並且將磷酸甘油酸（C）還原成磷酸甘油醛（C），這一過程也稱為【碳的固定】。

對於動物和其它非光合生物來說，磷酸戊糖途徑的氧化相是細胞中NADPH的主要來源，由它可以產生大約60%所需NADPH。

但是，也有其他幾個不太知名的機制能夠產生出NADPH，但是所有這些機制都依賴於線粒體的存在。

在這些過程中的一些起到關鍵作用的酶分別有：NADP聯蘋果酸酶、輔酶聯異檸檬酸脫氫酶、NADP聯谷氨酸脫氫酶以及煙醯胺核苷酸轉氫的異檸檬酸脫氫酶。

能夠產生NADPH的這幾個不太出名的機制中，有一部分的NADPH的來源疑似是脂肪，但是也不排除其主要來源是肝細胞的可能性。此外，在線粒體中，NADH激酶（NADH即為輔酶I的簡稱）產生的NADPH和ADP，使用NADH和ATP作為底物。

NADPH提供原材料以用於生物有機合成反應以及氧化-還原ROS（活性氧）的藥性，間接導致了谷胱甘肽（還原型谷胱甘肽）的再生。

NADPH及其相關也可用於合成代謝途徑，如脂質合成，膽固醇的合成，和脂肪酸鏈延長。

NADPH及其相關循環系統也負責在免疫細胞中產生自由基，這對人體的免疫系統無疑是十分重要的。這些基團將會被用於破壞病原體（或許與效應T細胞有關，但是效應B細胞，即漿細胞的可能性更大），這個破壞的過程被稱為呼吸爆發。呼吸爆發是芳香族化合物，甾族化合物，醇，和藥物的細胞色素P450羥化的來源。