反向重複序列
反向重複序列
反向重複序列指兩個序列相同的拷貝在DNA鏈上呈反向排列，是DNA重複序列的一種類型。反向重複序列散布在整個基因組中，約佔人類基因組中佔5%,常見於基因的調控區，可能與基因的轉錄、複製有關。反向重複序列的一種形式是反向排列的兩個拷貝間隔著一段序列，另一種 形式是兩個拷貝之間沒有間隔序列，呈反向串聯，這種結構又稱迴文式序列。
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反向重複序列 (inverted repeat sequence)：如圖一GTGCTAA和TTAGCAC構成反向重複序列。在雙鏈DNA中反向重複可能引起十字形結構的形成。（圖一上面的序列為反向重複序列，同時，注意到它兩條鏈順讀是一樣的，且中間沒有間隔序列，因此它是迴文序列；圖一下面的序列為鏡像重複序列。詳情參見下文辨析。）
迴文結構（palindromic structure）：在真核細胞染色質DNA分子中，還存在大量特殊的序列，這種結構中脫氧核苷酸的排列在DNA兩條鏈中順讀與倒讀其意義是一樣的，脫氧核苷酸的排列對於一個假象的軸成180°旋轉對稱，這種結構稱為迴文結構。
幾種重複序列辨析（非正式名詞解釋）：
反向重複序列 (Inverted repeat sequence) | 5'AAAANNNNTTTT3' 3'TTTTNNNNAAAA5' | 兩條鏈中以5'->3'方向讀出來是一樣的，兩條鏈旋轉對稱。 |
迴文序列 (Palindromic sequence) | 5'AAAATTTT3' 3'TTTTAAAA5' | 當反向重複序列中沒有“NNNN”時就稱為迴文序列，兩條鏈旋轉對稱。 |
正向重讀序列 (Direct repeats sequence) | 5'ATCGNNNNATCG3' 3'TAGCNNNNTAGC5' | 在同一條序列中有重複(NNNN的前後序列都是AAAA)，中間的NNNN可有可無。 |
鏡像重複序列 (Mirror repeats) | 5'ATCGNNNNGCTA3' 3'TAGCNNNNCGAT5' | 兩條鏈都呈軸對稱。 |
基本信息
- 中文名
- 反向重複序列
- 外文名
- inverted repeat sequence
- 分類
- 專有名詞
- 研究範圍
- 生物基因
- 應用
- 分子生物學