異質細胞heterocyst 亦稱異型細胞是雜混於藍藻類的絲狀形態結構種類的體細胞（顫藻除外）中的一種特殊細胞。與營養細胞不同，缺少光系統I。此類細胞一般透明，有細胞內含物。它們的分佈和形態是藍藻分類的重要指標。
異質細胞heterocyst，開始形成時與體細胞是通連的，但不久在體細胞的一個區段的內側形成第二胞壁，僅在前後二端與鄰接細胞的接觸部位殘存有原生質連絲。以後在該處又形成具有種的特異性的閉塞物（polar nodnle），這時細胞內含物變為透明。在生物學上的作用還不清楚，但在
魚腥藻中（Anabaena hallensis）有時從異質細胞的內含物形成藻殖段。由此看來，它可能就是生殖細胞的母體，這樣稱為異質細胞便無甚意義了。此外凡具有
固氮能力的藍綠都具有異質細胞。