一般來說生物學家是根據RNA能否直接起mRNA作用而分成單股正鏈RNA病毒(正股RNA病毒)與單股負鏈RNA病毒(負股RNA病毒)兩種。
(1)正股RNA病毒(如
脊髓灰質炎病毒)的單股RNA可直接起mRNA作用,轉譯早期
蛋白質,包括
RNA多聚酶和抑制
宿主細胞合成代謝的調控蛋白。然後在RNA多聚酶的作用下,以單股RNA(正股)為模板,形成互補股(負股),兩者結合成雙股,稱為
複製型。再由負股產生出許多新的RNA(正股),成為複製中間體。此新的正股RNA可作為mRNA合成衣殼蛋白。
(2)負股RNA病毒(如
正粘病毒、
副粘病毒、
彈狀病毒)的單股RNA不能作為mRNA,稱為負股,須先合成互補股(正股)作為mRNA,再轉譯蛋白分子,而後產生
核酸的複製型,成為合成子代病毒RNA的模板。