半知菌亞門

真菌門的 1亞門。因在其成員的生活史中僅發現了無性階段而得名。它們為具簡單隔膜（少數種具桶孔隔膜）的分枝菌絲體，菌絲每個細胞中常含多核。分生孢子梗單生、簇生或集結成孢梗束，其內（外）合生或離生產孢細胞，產孢細胞產生形形色色的分生孢子。

本亞門真菌只能以分生孢子或菌絲的斷片進行繁殖。由於半知菌的異核體現象為其隱性基因提供了庇護場所，異孢質作用增加了其遺傳變異的廣度和深度，准性生殖又為其核基因的交換提供了手段，從而使其能在物種形成與進化的長河中，得以保存並繁衍下來，發展為今天這樣一個種類多、繁殖快、分佈廣、適應性強的重要類群。

半知菌多腐生於陸地或水中。

1935年，W.B.格羅夫和1983年，D.L.霍克斯沃思將本亞門下分絲孢綱和腔孢綱2綱，約17000種。有些種是人類和動、植物的致病菌；有些種能導致食品腐敗以及原料、器材的腐蝕或變質；有些種的代謝產物可用於製取抗生素（如產生青霉素的青黴、產生頭孢黴素的頭孢霉等）、有機酸和酶製劑；有些種可用於有害昆蟲和雜草的生物防除。同時，半知菌也在生態系統中的物質和能量轉化中起重要的作用。

以往發現的半知菌中，有些種因為又相繼發現了它們的有性階段，而分別歸屬於子囊菌亞門（多數）和擔子菌亞門（少數）中，所以有的學者提出“半知菌是子囊菌的分生孢子階段，或者少數種是擔子菌的徠分生孢子階段，它們的有性階段未曾發現或已喪失”的見解。