新疆微生物學會於1979年9月新疆微生物學會正式成立。同時成立醫學微生物分會、免疫學分會、食用菌學會，掛靠在微生物所。
1.成立時間：1979年9月
2.歷史沿革：
當時吸收會員163人，並積極組織學術活動，普及科技知識，提高會員及各級科技工作者的學術水平和業務素質，邀請國內外著名專家學者來疆講學，開展學術交流，同時還積極組織本區的學術交流活動。之後，學會又召開過3次會員代表大會暨學術研討會，選舉產生過3屆理事會。2007年8月，召開由中國微生物學會主辦、新疆微生物學會承辦的“2007年中國微生物學會學術年會暨中美微生物學會
微生物感染與
免疫學術研討會”，共600餘名代表參加會議。截止目前，學會會員總數320餘人。