1942年11月成立。軍區領導機關由新四軍第4師領導機關兼。司令員彭雪楓,政治委員
鄧子恢,參謀長
張震,政治部主任吳芝圃。第9、第11旅分別兼第1、第2軍分區,另轄第3、第4軍分區。1943年下半年,軍區抗日武裝自衛委員會成立,發展地方武裝23000餘人,組建民兵59207人,自衛隊137062人。1944年9月11日彭雪楓犧牲后,
張愛萍任司令員。1945年10月華中軍區成立,淮北軍區撤銷,所屬軍分區編成華中軍區第7、第8軍分區。1946年6月恢復淮北軍區,並以華中野戰軍第9縱隊兼淮北軍區,司令員兼政治委員張震,副司令員
饒子健、杜新民,參謀長姚運良,政治部主任
王學武。