中國藥科大學理學院始建於1980年，2012年5月1日前稱“中國藥科大學基礎部”。中國藥科大學理學院完成或承擔國家和企業的科研項目近百項，國家級、省部級、校級教改課題數十項，主編“十五”、“十一五”國家規劃教材數十部，省級精品課程3門，獲國家級教學成果一等獎1項、二等獎1項，省級特等獎1項、二等獎2項，省級精品教材獎2項。中國藥科大學理學院暑期社會實踐活動多次獲得省級榮譽。
現設有2個專業：信息管理與信息系統專業、中國藥科大學環境科學專業
數學教研室、物理教研室、信息管理科學教研室、
分析化學教研室、
無機化學教研室、有機化學教研室、物理化學教研室和1個基礎化學實驗中心。
信息管理與信息系統專業擁有碩士、博士學位授予點，分析化學學科擁有碩士學位授予點。另擁有
藥物化學和
藥物分析專業碩士、博士學位授予點。中國藥科大學理學院有教職工180人，其中教授9人，副教授49人。
